18 жовтня 2017 року Київський апеляційний адміністративний суд підтвердив рішення суду першої інстанції про те, що Кабінет міністрів України (КМУ) незаконно передав ПАТ "Укрзалізниця" із підпорядкування Міністерству інфраструктури України в управління Міністерства економічного розвитку і торгівлі України (МЕРТ).
З цього приводу міністр інфраструктури Володимир Омелян на своїй сторінці у Facebook написав наступне: "Сьогодні Київський апеляційний адміністративний суд підтвердив незаконність передачі ПАТ "Укрзалізниця" із підпорядкування Мінінфраструктури Мінекономрозвитку. У судовому засіданні в ім'я України провозголошено постанову, згідно з якою апеляційні скарги КМУ і Мінекономрозвитку залишено без задоволення. Рішення суду вже набрало законної сили!"
Логіст.Today нагадує, що 18 січня 2017 року Кабінет міністрів вивів УЗ із підпорядкування МІУ і передав управління компанією МЕРТ. Це рішення було прийнято через конфлікт, який виник між міністром інфраструктури Володимиром Омеляном і тодішнім керівником "Укрзалізниці" Войцехом Бальчуном. За заявою Омеляна, польський менеджер недостатньо ефективно керував компанією. З свого боку Бальчун стверджував, що для проведення реформ необхідно більше часу і відзначав складність швидких змін у такій великій компанії, як УЗ.
4 серпня 2017 року Окружний адміністративний суд Києва прийняв рішення про незаконність перепідпорядкування ПАТ "Укрзалізниця", яке 18 жовтня було підтверджено Київським апеляційним адміністративним судом.